細胞株在生物制藥中使用非常廣泛，細胞株培養條件簡單，貼壁強度適中，比較容易轉染，很適合用它來研究一般哺乳動物基因的功能。細胞培養過程中的污染不僅僅指微生物，而且還包括所有混入培養環境中的、對細胞生存有害或造成細胞不純的物質，包括生物和化學物質。
細胞株的篩選我們要注意加藥時間以及維持濃度：
1.由于基因轉染到細胞內之后要一段時間才能表達出蛋白質。所以細胞株篩選時不能太早;但是也不能太晚，因為轉染了外源基因的細胞代謝負荷較大，增值較慢，時間長了就會被沒有外源基因轉入的細胞所淹沒，終導致篩選不出陽性克隆，一般要在轉染24小時之后才開始加篩選。隨著細胞的代謝，濃度和活性都會下降，所以每3-5天都要更換一次篩選液。
2.加抗生素的時機，主要是考慮插入到細胞基因組的抗性基因是否已經得到表達。一般是轉染48小時后加入抗生素。挑出單克隆后就可以用維持濃度，一般是穩定細胞株篩選濃度的1/2。
關于維持濃度，有人說細胞會出現對抗生素的抗性，應不斷提高其濃度。而且如果要挑選幾個陽性克隆中較高表達的克隆的話，可以調整抗生素的濃度。當然，抗性基因高表達，目的基因不一定就跟著高表達。
此外，也需穩定細胞系構建培養液：
加藥篩選穩定細胞株約6天左右，細胞會大量死亡，孔中只剩下的細胞*。這時會出現：
1.死亡的細胞會裂解釋放出有害物質，導致那些有表達陽性細胞死亡，即非選擇性死亡，因此要及時換液。
2.孔中細胞數目很少，細胞之間的信號會變得很弱，也會導致陽性細胞的狀態不佳甚至死亡。這個時候需要一種特殊的培養液，再轉染后篩選穩轉細胞株過程中就可以應用這種培養基。
3.適當增加血清濃度。
